基于Cyt-b和D-loop序列的中国南海高体鰤野生与养殖群体遗传多样性及遗传结构OACHSSCD

【目的】评估中国南海野生高体鰤(Seriola dumerili)群体的遗传多样性现状,并量化分析人工繁育对子代群体遗传结构的影响。【方法】采集中国南海主要海域的5个野生群体(海南三亚、广东惠东、广东阳江、广东湛江、福建东山)和1个养殖群体,共196尾个体。利用两种线粒体分子标记--线粒体细胞色素b(Cyt-b)和控制区(D-loop),结合生物信息学分析,评估群体的遗传多样性水平、分化格局及历史动态。【结果】利用Cyt-b和D-loop标记分别鉴定出60、104个单倍型。结果显示,我国南海高体鰤野生群体具有较高的遗传多样性,其中广东惠东与广东湛江群体的D-loop单倍型多样性(Hd)均超过0.98。相比之下,养殖群体呈现明显的遗传多样性下降,其D-loop单倍型多样性降至0.785,且核苷酸多样性(π)显著低于野生群体。各群体间有轻度的遗传分化(6群体间FST=0.039,P<0.001),这种分化主要源于养殖群体与野生群体间。单倍型网络图呈典型的星状辐射结构,结合中性检验与错配分布分析,提示高体鰤种群在晚更新世曾经历过快速扩张。【结论】中国南海野生高体鰤群体遗传多样性丰富且各群体间无显著遗传分化,种群基因交流频繁,是天然种质库。人工繁育虽未导致多样性水平的剧烈骤降,但已引起养殖群体遗传结构的显著偏移和优势单倍型的改变。在未来的育种实践中,应重点监测亲本贡献率以维持遗传平衡,并优先利用遗传多样性较高的野生群体进行种质复壮,防止近交衰退。