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蓝莓PP2C基因家族鉴定及干旱胁迫响应分析OA

中文摘要

为筛选出蓝莓中响应干旱胁迫的PP2C基因,利用生物信息学分析从蓝莓基因组中鉴定出91个PP2C基因,不均匀分布于41个支架上。系统进化分析表明,VcPP2Cs共分为9个亚家族,其不同成员的基因结构和保守基序存在差异。顺式作用元件分析显示,VcPP2Cs基因启动子区域共含有1693个胁迫响应元件和800个激素响应元件。GO和KEGG分析显示,VcPP2Cs主要富集到分子功能、细胞成分和生物过程,主要被注释到了“信号传导”通路。此外,基于干旱转录组数据筛选到22个差异基因。其中,差异表达6倍以上的基因共有5个,VcPP2C45、VcPP2C46、VcPP2C51、VcPP2C53和VcPP2C54。qRT-PCR结果显示,上述5个基因的表达水平均受干旱胁迫诱导显著上调,可能参与蓝莓干旱胁迫响应过程。

纪媛媛;刘佳丽;田琴;苏来曼·吐达洪;王琳;曹一博;张凌云

森林培育与保护教育部重点实验室(北京林业大学),北京100083森林培育与保护教育部重点实验室(北京林业大学),北京100083森林培育与保护教育部重点实验室(北京林业大学),北京100083森林培育与保护教育部重点实验室(北京林业大学),北京100083森林培育与保护教育部重点实验室(北京林业大学),北京100083森林培育与保护教育部重点实验室(北京林业大学),北京100083森林培育与保护教育部重点实验室(北京林业大学),北京100083

农业科技

蓝莓干旱胁迫激素PP2C蛋白磷酸酶

《东北林业大学学报》 2026 (5)

P.1-14,14

山东省重点研发计划(2024LZGCQY025)北京市自然科学基金项目(6222041)北京林业大学“5·5工程”科研创新团队项目(BLRC2023B08)。

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