武定鸡NRAMP1基因表达及编码区多态性与鸡白痢抗性的关联分析OA

【目的】探究天然抗性相关巨噬细胞蛋白1(natural resistance-associated macrophage protein 1,NRAMP1)基因在武定鸡不同组织中的表达差异及其编码区多态性,并对其与鸡白痢抗性的关联进行分析,以期为鸡抗病育种提供有效的候选分子标记。【方法】通过分子诊断技术鉴定武定鸡个体的鸡白痢沙门氏菌感染状态,将其分为感染组与未感染组;运用qRT-PCR技术检测2组个体胸腺和脾脏中NRAMP1基因的表达水平;采用PCR产物直接测序法筛查NRAMP1基因编码区的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP),并分析SNP位点与鸡白痢抗性的相关性,进而筛选功能性SNP。【结果】分子诊断结果显示:武定鸡鸡白痢的阳性率和阴性率分别为42.1%和57.9%。qRT-PCR分析表明:未感染组胸腺和脾脏组织中NRAMP1基因的mRNA表达水平极显著高于感染组(P<0.01)。在NRAMP1基因外显子2、外显子8和外显子9中共检测到8个SNP位点,其中,c.163A>G(外显子2)、c.668G>A(外显子8)和c.919G>A(外显子9)为错义突变。关联分析显示:感染组与未感染组的c.163A>G位点基因型频率差异极显著(P<0.01)。【结论】NRAMP1基因的表达水平与鸡白痢抗性密切相关,且外显子2上的c.163A>G位点可能是影响鸡白痢抗性的关键功能性突变,可作为鸡抗病育种的潜在分子标记。