水稻耐热基因TT2的特异性鉴定标记开发OA
Development of Markers for Specific Identification of the Heat-tolerant Gene TT2 in Rice
针对水稻耐热基因 TT2,开发高效分子鉴定标记,以加速耐高温水稻种质资源的精准筛选与品种选育.基于扩增阻滞突变系统 PCR(ARMS-PCR)的基本扩增原理,利用 TT2 基因单核苷酸多态性(SNP)差异,分别设计了适用于琼脂糖凝胶电泳、毛细管电泳及五引物扩增受阻突变体系(PARMS)技术的 3 套特异性引物,可准确区分 TT2 的不同基因型.其中,琼脂糖凝胶电泳鉴定标记通过条带大小区分 TT2 基因型,准确性高且操作简便;毛细管电泳鉴定标记借助不同荧光片段大小区分 TT2 基因型,检测通量高且速度快;PARMS 标记则通过酶标仪对 TT2 基因型实现高通量精准分型,且更快、更简便.这 3 种不同检测方式的分子标记可满足不同实验室的检测需求,实现对 TT2 优异单倍型的精准鉴定,为水稻耐热基因聚合和耐热新品种选育提供关键技术,推动耐热水稻育种发展.
This study developed high-efficiency molecular identification markers for the heat-tolerant gene TT2 in rice,so as to accelerate the precise screening of heat-tolerant germplasm resources and heat-tolerant variety breeding of rice.According to the basic principle of amplification of amplification refractory mutation system PCR(ARMS-PCR)and the single nucleotide polymorphism(SNP)differences within the TT2 gene,three sets of specific primers were designed for the agarose gel electrophoresis,capillary electrophoresis,and penta-primer amplification refractory mutation system(PARMS)technology,respectively,enabling accurate discrimination of different TT2 genotypes.The agarose gel electrophoresis marker identified TT2 genotypes by the amplicon size,with high accuracy and simple operation.The capillary electrophoresis marker distinguished TT2 genotypes via the fluorescent fragment size,offering high throughput and speed.The PARMS marker achieved high-throughput and precise TT2 genotyping via a microplate reader,which was faster,simpler and more convenient.These three molecular marker systems with different detection methods can meet the detection requirements of laboratories with varied conditions,allowing the accurate identification of elite TT2 haplotypes.They provide key technical tools for pyramiding heat-tolerant genes and breeding new heat-tolerant varieties of rice,thereby promoting the development of heat-tolerant rice breeding.
陈若凡;陆佳雨;许学;吴爽;王沛然;张梦柯;石英尧;汪秀峰
安徽农业大学 农学院,安徽 合肥 230036安徽省农业科学院 水稻研究所/农业农村部 农作物生态环境安全检验测试中心(合肥),安徽 合肥 230031安徽省农业科学院 水稻研究所/农业农村部 农作物生态环境安全检验测试中心(合肥),安徽 合肥 230031安徽省农业科学院 水稻研究所/农业农村部 农作物生态环境安全检验测试中心(合肥),安徽 合肥 230031安徽省农业科学院 水稻研究所/农业农村部 农作物生态环境安全检验测试中心(合肥),安徽 合肥 230031安徽农业大学 农学院,安徽 合肥 230036安徽农业大学 农学院,安徽 合肥 230036安徽省农业科学院 水稻研究所/农业农村部 农作物生态环境安全检验测试中心(合肥),安徽 合肥 230031
农业科技
水稻TT2 基因标记开发琼脂糖凝胶电泳毛细管电泳PARMS 技术
riceTT2 genemarker developmentagarose gel electrophoresiscapillary electrophoresisPARMS technology
《杂交水稻》 2026 (2)
11-20,10
水稻种质创新与分子改良安徽省重点实验室开放基金项目(SDKF-2024-05)
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