基于网络药理学和分子对接技术探讨山药-玄参治疗慢性萎缩性胃炎的分子机制OA

目的:基于网络药理学和分子对接技术探讨山药-玄参治疗慢性萎缩性胃炎(CAG)的作用机制.方法:在中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)中分别检索山药、玄参的活性成分,运用瑞士靶点预测平台(SwissTar-getPrediction)进行作用靶点预测,通过人类基因数据库(GeneCards)、疾病基因关联网络数据库(DisGeNET)及在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)筛选CAG疾病靶点,将疾病靶点与山药-玄参活性化合物作用靶点相交集,利用Cytoscape 3.8.2软件构建"药物-活性化合物-交集靶点"网络图,并利用STRING平台、Cytoscape软件、CentiScape 2.2插件构建蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI),筛选核心靶点,通过R语言对交集靶点进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,并进行可视化分析,最后利用CB-dock2进行分子对接,验证核心靶点与关键成分的结合活性.结果:经筛选获得有靶点的山药-玄参化合物13个,成分靶点基因与疾病靶点交集后构建PPI,涉及靶点73个,核心靶点为CCND1、EGFR、CASP3、mTOR、Src,主要核心化合物为荜茇明宁碱、玉兰脂B、海风藤酮、薯蓣皂苷元、柳杉醇.GO富集分析共涉及1 969个生物过程、54个细胞定位、107个分子功能;KEGG富集分析得到表皮生长因子受体(EGFR)信号通路、人表皮生长因子受体家族(ErbB)信号通路、癌症信号通路、化学致癌-受体激活、卡波氏肉瘤相关疱疹病毒感染、催乳素信号通路等.分子对接结果表明,主要药物活性成分荜茇明宁碱、玉兰脂B、海风藤酮、薯蓣皂苷元、柳杉醇能够与疾病核心靶点CCND1、EGFR、CASP3、mTOR、Src结合,展现出较好的亲和力.结论:本研究基于网络药理学与分子对接技术,初步揭示山药-玄参药对治疗慢性萎缩性胃炎的多成分-多靶点-多通路作用机制.