基于转录组测序数据的烟粉虱病毒鉴定及系统发育分析OA

烟粉虱(Bemisia tabaci)是传播植物病毒的重要媒介,针对烟粉虱自身感染的昆虫病毒研究却相对较少.本研究利用二代测序技术(Next generation sequencing,NGS)鉴定了烟粉虱体内可能存在的昆虫RNA病毒.以烟粉虱基因组为参考,剔除了宿主序列后,剩余6.8 GB的高质量清洁读序用于Trinity组装和功能注释,共鉴定到47297个unigenes,其中79个与节肢动物RNA病毒具有显著相关性(53个unigenes的长度超过500 bp).通过PCR和RT-PCR进一步筛选这些unigenes,排除了可能的非逆转录内源性病毒,最终在烟粉虱中鉴定出19个与昆虫相关的病毒样序列(virus-like sequences,VLSs).其中,10个VLSs包含完整的RNA依赖性RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase,RdRp)保守域,表明它们代表了 10个新发现的病毒种类.系统发育分析显示,这些新病毒隶属于6个主要分类群:类甲病毒超家族(Alphavirus-like superfamily)、小核糖病毒目(Picornavirales)、单链负义病毒目(Mononegavi-rales)、布尼亚病毒目(Bunyavirales)、金色病毒科(Chrysoviridae)和分体病毒科(Partitiviridae).本研究详细阐述了烟粉虱中10种新型昆虫病毒的鉴定及系统发育分析,并对5种具有完整编码序列(Coding sequences,CDS)的病毒基因组结构进行了深入分析.研究结果表明烟粉虱可以感染多种昆虫RNA病毒,这为进一步探讨昆虫与病毒的相互作用提供了参考.