苍术属植物叶绿体密码子偏好性分析OA
为探究苍术属药用植物叶绿体基因组基因密码子使用偏好性,以关苍术、苍术、白术、鄂西苍术叶绿体基因组的52 条共有基因序列为材料,利用EMBOSS在线工具和CodonW1.4.2 软件,统计各基因的有效密码子数、核苷酸百分比、同义密码子使用频率、密码子总GC含量及密码子 3 位GC含量(GC1、GC2、GC3),并通过PR2-plot分析、ENC-plot 分析和中性绘图分析,最终鉴定出最优密码子.结果表明,4 种苍术属植物叶绿体基因组密码子偏好以A/U 结尾.PR2-plot、中性绘图及ENC-plot分析结果显示,苍术属植物叶绿体基因组密码子使用偏好受突变压力与自然选择共同影响;共鉴定出5 个最优密码子(UUA、UCU、ACU、GCU、UAA),且最优密码子均以A/U结尾.本研究揭示了苍术属密码子偏性形成的主要影响因素,为苍术属叶绿体基因组密码子优化、物种进化及遗传育种研究提供了支撑.
何培;孙会改;荣正普;郑玉光;韩晓伟;裴林
河北中医药大学第四附属医院,河北 石家庄 050031河北中医药大学,河北 石家庄 050200河北中医药大学,河北 石家庄 050200河北化工医药职业技术学院,河北 石家庄 050026河北中医药大学,河北 石家庄 050200河北中医药大学第四附属医院,河北 石家庄 050031
农业科技
苍术属密码子偏性最优密码子突变压力自然选择
《江苏农业科学》 2026 (3)
41-49,9
国家中医药管理局科技司中药质量保障与创新发展项目(编号:2024002845)中央本级重大增减支项目(编号:2060302-2405-03)河北省省级科技计划(编号:H2024423018、22326418D)河北省现代农业产业技术体系建设专项(编号:HBCT2023080201、HBCT2023080205)河北省中医药管理局科研计划(编号:2023351).
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