基于生物信息学、网络拓扑策略探索针刺治疗骨癌痛的机制OA

目的 运用文本挖掘、生物信息学、网络拓扑学等方法,探究针刺治疗骨癌痛(bone cancer pain,BCP)的分子机制.方法 检索Pubmed、Embase、Web of Science、中文期刊全文数据库、万方数据库和维普数据库中针灸治疗骨癌痛文献,检索时间为建库至2024年8月31日;筛选出针刺后产生的活性化合物,并通过Pubchem和Swiss Target Prediction数据库获得其关键靶点.通过Gencards数据库以及OMIM数据库得到BCP的关键靶点.将针刺后产生活性化合物的关键靶点与 BCP 的关键靶点录入微生信平台绘制 venny 图,并获取针刺治疗BCP的核心靶点.将核心靶点分别导入Cytoscape 3.10、String数据库构建"针刺-活性化合物-BCP-靶点"网络图以及PPI网络图,并利用cytoNCA插件进行拓扑分析及可视化,将针刺治疗BCP潜在靶点录入微生信平台进行富集分析.结果 最终筛选出 4 种与针刺效应相关的活性化合物以及 91 个关键靶点;1 743 个BCP的关键靶点;31 个针刺治疗BCP的核心靶点,90条GO富集分析条目以及 184条KEGG通路.结论 针刺可能通过作用于基质金属蛋白酶 2、半胱氨酸天冬氨酸蛋白水解酶 3、组织蛋白酶、基质金属蛋白酶 3、原癌基因c-FOS、基质金属蛋白酶 1 等核心靶点,通过调节胶原蛋白分解及代谢、细胞外基质降解、膜筏、细胞因子结合等,从而达到治疗BCP的目的.