闽楠PIF基因家族鉴定和表达模式研究OA

[目的]对闽楠光敏色素相互作用因子PIF家族进行鉴定,并探究其在生长发育中的功能。[方法]利用生物信息学与荧光定量PCR等方法,对PbPIFs基因家族进行了全基因组鉴定,分析其蛋白理化特性、基因结构、进化关系、亚细胞定位及启动子顺式作用元件和光响应下的表达模式。[结果]从闽楠全基因组中共鉴定出9个PbPIFs基因,具有高度保守的bHLH结构域,同时包含APA结构域或APB结构域。亚细胞定位结果显示PbPIFs蛋白均定位于细胞核。PbPIFs基因上游启动子区域存在光响应、干旱、低温及激素相关的顺式作用元件,其中ABA的响应元件数量最多。PbPIFs家族成员间表现出组织部位表达分化,同时荧光定量PCR结果表明PbPIF1、PbPIF3a、PbPIF3b和PbPIF5等在光照诱导下表达显著下调,表明这些基因可能参与光形态建成。[结论]闽楠9个PbPIFs基因间表现出功能分化,不同成员参与响应光信号及非生物胁迫等不同环境因子信号,研究结果为深入解析闽楠PIF家族成员的基因功能及其环境响应的调控机制提供科学依据。