基于生物信息学分析识别慢性萎缩性胃炎癌变的关键基因及中医药治疗规律OA

目的通过生物信息学分析识别慢性萎缩性胃炎(chronic atrophic gastritis,CAG)癌变过程中的关键基因及信号通路,基于多数据库文献分析与中药复方数据挖掘,明确中医药治疗CAG的用药规律及其潜在机制。方法从基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)获取GSE116312数据集,识别并挖掘CAG-胃癌(gastric cancer,GC)、CAG-滤泡性胃炎(follicular gastritis,FG)和FG-GC之间共有的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),构建蛋白质-蛋白质相互作用(proteinprotein interaction,PPI)网络,识别枢纽基因,使用EnrichR、ShinyGO等工具进行基因本体论(Gene Ontology,GO)功能富集分析。系统检索PubMed、Embase等7个数据库中符合条件的文献,Meta分析评估中药联合西药对比单纯西药治疗的疗效,通过关联规则分析和贝叶斯网络模型挖掘核心中药及其配伍模式。结果共筛选出17个CAG癌变相关的共有DEGs,MCM7、CDC6、CDC45、MCM2、MCM4、CDK1、MCM3、CDK2、PCNA和RFC4为PPI网络的前10个枢纽基因,显著富集于DNA复制、细胞周期调控、G1/S期转换等生物学过程,以及P53信号通路、错配修复等癌症相关通路。临床Meta分析共纳入12项随机对照试验,中药复方联合西药治疗可显著提高临床有效率(合并相对危险度=4.87,95%置信区间为3.24~7.30,P<0.001),异质性低(I2=0%)。中药配伍规律挖掘识别出党参、白芍、茯苓、黄连、半夏、陈皮、丹参7味核心中药,“党参-白术”为最高频药对。结论MCM7、CDC6等枢纽基因可作为CAG癌变早期筛查的潜在生物标志物,临床Meta分析证实中药复方联合西药在CAG治疗中具有显著优势,配伍规律挖掘为核心复方制剂的开发提供了药物组合与理论支持。