白菜型油菜ICE基因家族鉴定及其响应低温表达分析OA

ICE(inducer of CBF expression)基因家族是植物低温信号转导通路中的重要转录调控因子之一,为系统解析白菜型油菜中ICE家族的成员特征及其低温响应表达模式,基于白菜型油菜全基因组数据,通过BLAST与HMM方法鉴定出74个ICE基因家族成员。染色体定位结果显示,该家族在全部10条染色体上均有分布,其中以第9号染色体上成员数最多。蛋白质特性分析显示,所有成员均定位于细胞核,分子量和等电点差异较大,70个成员蛋白不稳定性指数超过稳定性阈值。基因结构与保守功能模块分析揭示成员间结构组成存在多样性,其中Motif 1和Motif 2在绝大多数成员中高度保守。共线性分析表明,该家族扩展主要受全基因组复制与片段复制事件驱动。启动子区顺式调控元件分析显示大部分基因含有光响应、ABA、MeJA及MYB结合位点等顺式调控元件,其中34个BraICE含有低温响应元件。基于西藏白菜型油菜转录组数据的表达分析发现,BraICE17在低温处理后表达上调幅度最大,BraICE35表达下调幅度最为明显,qRT-PCR实验总体支持转录组数据的可靠性。本研究结果为进一步解析BraICE的分子功能与低温应答机制奠定了理论基础,并提供了潜在的耐寒研究基因资源。