太白贝母种子低温萌发过程中C3H基因家族鉴定及表达分析OA
为解析C3H基因在太白贝母种子萌发过程中的作用,基于低温萌发转录组数据,该研究通过生物信息学的方法对太白贝母C3H基因家族进行系统鉴定及表达分析,筛选出5个低温高表达候选基因并解析其对赤霉素(GA3)和脱落酸(ABA)的响应机制。结果表明:(1)C3H家族65个成员中7个为稳定亲水蛋白、58个不稳定亲水蛋白,蛋白长度差异显著(197~1451 aa),仅FtC3H43和FtC3H50定位于叶绿体/内质网,其余位于细胞核。(2)保守基序分析发现,Motif1和Motif3普遍存在C3H蛋白中;系统进化分析结果显示,196条C3H蛋白被聚类为5个不同的分支,分别标记为I-Ⅴ,太白贝母C3H成员与拟南芥和水稻表现出较近的亲缘关系。(3)GA3处理下,FtC3H22和FtC3H35在A-C时期促进萌发,FtC3H40在A期、FtC3H46在E期响应调控;ABA处理时FtC3H46显著上调,而FtC3H22和FtC3H35下调,推测FtC3H46参与ABA介导的抗寒途径,FtC3H22和FtC3H35则正向调控萌发。该研究揭示了C3H蛋白家族在太白贝母种子萌发过程中的重要作用和复杂调控机制。
袁媛;董家帮;徐艳姣;李炎;张晓玉;吴靓;陈永生;梁艳丽
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农业科技
太白贝母C3H种子萌发生物信息分析表达模式
《广西植物》 2026 (1)
P.110-122,13
云南省科技厅重大科技专项(202302AA310030)云南省科技厅乡村振兴科技专项(202304BI090009)云南省科技厅农业联合专项(202101BD070001-008)迪庆藏族自治州科技计划项目(2023ZXND01)科技人才与平台计划项目(202005AC160040)。
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