豇豆种质资源的KASP分子标记鉴定与遗传分析OA
Molecular Identification and Genetic Analysis of Cowpea Germplasm Resources Based on KASP Markers
豇豆[Vigna unguiculata(L.)Walp.]是我国重要的大宗豆类蔬菜作物,开展其种质资源基因型鉴定与遗传多样性研究,对遗传资源保护、发掘和利用具有重要意义.本研究利用46个KASP分子标记对202份豇豆种质进行基因型分析和遗传多样性分析.结果表明:群体基因多样性(GD)均值为0.39(变异范围0.03~0.52),多态信息含量(PIC)均值为0.32(变化范围0.03~0.42),主等位基因频率(MAF)均值为0.69(变化范围0.50~0.99),反映出供试豇豆材料遗传多样性处于中等偏低水平,可能限制育种潜力.STRUCTURE分析将材料划分为3个遗传距离较近的亚群(遗传距离变化范围0.01~0.02).采用邻接法(NJ)聚类将材料划分为4个类群,其中类群Ⅰ以地方种为主,类群Ⅱ以商品种为主.此外,本研究基于KASP标记构建了202份豇豆种质的分子指纹图谱,并揭示了其KASP变异位点的SNP主要组成类型,筛选出18份代表性材料作为微核心种质资源,为豇豆资源分子保护与利用提供了依据.
Cowpea[Vigna unguiculata(L.)Walp.]is a major leguminous vegetable in China.Studies on genotype identification and genetic diversity of its germplasm resources are of great significance for the conservation,exploration,and utilization of genetic resources.In this study,46 KASP molecular markers were used to detect and analyze 202 cowpea accessions.The results showed that the average gene diversity(GD)was 0.39(with a variation range of 0.03-0.52),the polymorphism information content(PIC)value was 0.32(with a variation range of 0.03-0.42),and the average major allele frequency(MAF)was 0.69(with a variation range of 0.50-0.99).This indicates that the genetic diversity of the tested cowpea materials is moderately low,which may restrict breeding potential.STRUCTURE analysis divided them into 3 subpopulations with relatively close genetic distances(0.01-0.02).Neighbor-joining(NJ)clustering classified all the cowpea accessions into 4 groups,among which group Ⅰ is mainly local varieties and group Ⅱis mainly commercial varieties.Based on these KASP markers,this study constructed molecular fingerprints of 202 cowpea germplasms,revealed the main SNP composition types at KASP variation sites,and screened 18 representative cowpea germplasms as mini-core germplasm resources,providing a scientific basis for the molecular conservation and utilization of cowpea resources.
梅翔;苏晓佳;朱姝萌;胡格格;吴新义;李国景;潘磊
江汉大学生命科学学院,湖北省豆类(蔬菜)植物工程技术研究中心,湖北省食用豆类植物自然科技资源中心,湖北 武汉 430056江汉大学生命科学学院,湖北省豆类(蔬菜)植物工程技术研究中心,湖北省食用豆类植物自然科技资源中心,湖北 武汉 430056江汉大学生命科学学院,湖北省豆类(蔬菜)植物工程技术研究中心,湖北省食用豆类植物自然科技资源中心,湖北 武汉 430056江汉大学生命科学学院,湖北省豆类(蔬菜)植物工程技术研究中心,湖北省食用豆类植物自然科技资源中心,湖北 武汉 430056浙江省农业科学院蔬菜研究所,浙江 杭州 310021浙江省农业科学院蔬菜研究所,浙江 杭州 310021江汉大学生命科学学院,湖北省豆类(蔬菜)植物工程技术研究中心,湖北省食用豆类植物自然科技资源中心,湖北 武汉 430056
豇豆KASPSNP基因分型遗传多样性
cowpeaKASPSNPgenotypinggenetic diversity
《中国蔬菜》 2026 (1)
71-84,14
国家自然科学基金项目(31501369),湖北省科技创新基地(平台)计划项目(2024CFA018),湖北省科技计划自然科学基金面上项目(2017CFB442),湖北省食用豆类植物自然科技资源中心主任基金项目(2017-ZR01),湖北省豆类(蔬菜)植物工程技术研究中心开放基金项目(2019-01)
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