苦荞FtWRKY28基因克隆及其在低磷与激素诱导下的表达分析OA北大核心CSCDCSTPCD
[目的]WRKY转录因子参与植物对低磷胁迫反应的调控。基于前期苦荞在低磷胁迫下的转录组数据,克隆FtWRKY28基因,预测基因及其编码蛋白的序列结构特征,分析基因在各器官中以及在低磷和激素处理下的表达模式、蛋白的亚细胞定位与转录激活活性,为阐明基因的生物学功能奠定基础。[方法]基于苦荞基因组数据库注释设计特异引物,用逆转录PCR从低磷处理的苦荞根RNA样中克隆FtWRKY28的完整编码序列,用生物信息学方法分析基因与蛋白的结构以及同源蛋白的进化关系,用实时荧光定量分析基因的表达模式,用拟南芥原生质体瞬时表达体系分析蛋白的亚细胞定位,用酵母单杂交分析蛋白的转录激活活性。[结果]FtWRKY28的完整编码序列长876bp,编码1个含291个氨基酸、有1个WRKY结构域、锌指结构域为C2H2型的蛋白,归属WRKY家族Ⅱ组。FtWRKY28绝大部分定位于细胞核,具有转录激活活性。FtWRKY28在根中表达水平最高,受低磷、吲哚乙酸、赤霉素3和6-苄氨基嘌呤显著诱导。[结论]FtWRKY28具有转录因子的基本结构与生物化学特征,可能通过生长素、赤霉素、细胞分裂素信号网络的交互作用,调控苦荞在低磷胁迫下的响应过程。
文碧瑶;彭喜旭;田建红;邬清韬;王海华;唐新科
湖南科技大学生命科学与健康学院,湖南湘潭411201湖南科技大学生命科学与健康学院,湖南湘潭411201 经济作物遗传改良与综合利用湖南省重点实验室,湖南湘潭411201 重金属污染土壤生态修复与安全利用湖南省高校重点实验室,湖南湘潭411201湖南科技大学生命科学与健康学院,湖南湘潭411201湖南科技大学生命科学与健康学院,湖南湘潭411201湖南科技大学生命科学与健康学院,湖南湘潭411201 经济作物遗传改良与综合利用湖南省重点实验室,湖南湘潭411201 重金属污染土壤生态修复与安全利用湖南省高校重点实验室,湖南湘潭411201湖南科技大学生命科学与健康学院,湖南湘潭411201 经济作物遗传改良与综合利用湖南省重点实验室,湖南湘潭411201 重金属污染土壤生态修复与安全利用湖南省高校重点实验室,湖南湘潭411201
农业科技
苦荞低磷胁迫WRKY基因基因表达结构预测生化特征
《西北植物学报》 2024 (6)
P.930-937,8
科技部国家重点研发计划项目(2017YFE0117600)湖南省教育厅重点科研项目(19A176)。
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