基于电子病历的表型分析方法及应用综述OA
目的:对基于电子病历的表型分析流程、主要方法、应用现状进行总结梳理,为后续相关研究提供借鉴。方法:通过关键词检索、参考文献回溯等方法在PubMed数据库中检索并经人工筛选后获得53篇文献,在此基础上总结了表型分析的一般流程,对表型定义及表型算法开发、验证和共享进行了综述,最后归纳了表型分析在临床研究中的应用现状。结果:表型分析的数据来源丰富,包括开放医学资源、结构化和非结构化电子病历数据等,表型算法开发的方法逐渐从基于规则开发向无监督学习开发转变,但目前电子病历数据的利用仍有很多挑战和困难有待解决。结论:今后应继续致力于提高数据的可信度,增加数据来源和种类以提升表型算法的效果,同时还应加强表型分析相关研究的共享和传播、扩大表型分析在临床研究中的应用。
王梓阳;杨林;王嘉阳;李姣
中国医学科学院/北京协和医学院医学信息研究所/图书馆,北京100020中国医学科学院/北京协和医学院医学信息研究所/图书馆,北京100020中国医学科学院/北京协和医学院医学信息研究所/图书馆,北京100020中国医学科学院/北京协和医学院医学信息研究所/图书馆,北京100020
信息技术与安全科学
表型分析表型算法电子病历表型验证表型共享
《中华医学图书情报杂志》 2022 (1)
P.38-48,11
北京市自然科学基金重点研究专题“基于机器学习的动脉粥样硬化性脑血管病的深度表型分析及预后研究”(Z200016)中国医学科学院创新工程“医学知识管理与智能化知识服务关键技术研究”(2021-I2M-1-056)。
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