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Des(rhamnosyl)verbascoside抗HBV作用的定量蛋白质组学研究OA北大核心CSTPCD

中文摘要

为探究des(rhamnosyl)verbascoside体外抗乙型肝炎病毒(HBV)的活性作用和机制,本研究以des(rhamnosyl)verbascoside为实验药物对HepG2.2.15细胞进行干预,实验分为药物干预组和对照组,采用串联质谱标签(Tandem Mass Tag,TMT)蛋白质组学方法对提取的总蛋白进行分析。结果表明,共筛选得到300个差异表达蛋白,其中有109个上调蛋白,191个下调蛋白。基因本体论(Gene Ontology,GO)分析结果显示,差异蛋白主要参与DNA复制(DNA replication)、鞘糖脂代谢(Glycosphingolipid metabolic process)、细胞增殖(Cell proliferation)、寡糖分解代谢(Oligosaccharide catabolic process)等生物学过程,以及DNA聚合酶活性(DNA polymerase activity)、丝氨酸型羧肽酶活性(Serine type carboxypeptidase activity)、DNA引物酶活性(DNA primase activity)等分子功能。京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)分析结果显示,差异蛋白主要参与细胞代谢(Metabolism)、遗传信息传导(Genetic information processing)、生物系统通路(Organismal systems)等相关信号通路。亚细胞定位分析表明,差异蛋白大多定位在细胞质和细胞核。本研究共筛选出13个与抗HBV密切相关的蛋白。通过定量蛋白组学初步揭示des(rhamnosyl)verbascoside可能通过增加HGF、SORT1、MAN2B1,减少PRIM1、PRIM2、POLA1、POLD3、POLD2、POLD1、POLE、ERCC2、LAMC1、SDC1等蛋白表达来起到体外抗HBV的作用。

邓洁;赵童诗尧;牟俊飞;梁成钦;周先丽;

桂林医学院智能医学与生物技术学院,广西桂林541004桂林医学院药学院,广西桂林541004

中医学

des(rhamnosyl)verbascoside;蛋白组学;乙型肝炎病毒;生物信息学;旱田草

《广西科学》 2024 (001)

P.197-204 / 8

国家自然科学基金项目(82060787,31560100);广西自然科学基金项目(2017GXNSFAA198242)资助。

10.13656/j.cnki.gxkx.20221118.001

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