基于基因集富集分析阐释补肺健脾方干预巨噬细胞炎症反应配伍机制OACSTPCD

目的:利用基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)和巨噬细胞炎症反应模型,基于通路水平阐释补肺健脾方干预慢性阻塞性肺疾病的配伍机制。方法:利用LPS诱导巨噬细胞建立炎症反应模型,分别给予补肺健脾方的12味中药干预,利用Illumina高通量测序平台得到基因表达谱数据。采用GSEA方法鉴定巨噬细胞炎症反应相关通路,通过富集评分(normalized enrichment score,NES)筛选中药干预后显著回调的通路,揭示补肺健脾方及其配伍的干预机制。结果:与对照组比较,模型组筛选到244条显著扰动通路(GSEA,FDR<0.05)。以得到的显著扰动通路为对象,补肺健脾方所含中药显著回调通路的NES为-1041.56,其中补肺配伍的为-71.25,健脾配伍的为-17.45,温肾配伍的为-211.42,止咳化痰配伍的为-363.94,活血通络配伍的为-377.5;补肺健脾方可显著回调214条通路(逆转率为87.70%),其中补肺配伍的为43条,健脾配伍的为19条,温肾配伍的为133条,止咳化痰配伍的为142条,活血通络配伍的为187条,逆转率分别为17.62%、7.79%、54.51%、58.20%、76.64%。Positive regulation of interleukin 1 production等7条通路在5个配伍中均被显著回调。Mitotic cell cycle arrest等通路在补肺配伍中特异回调。Response to acetylcholine通路在健脾配伍中特异回调。Negative regulation of viral entry into host cell等通路在温肾配伍中特异回调。Negative regulation of leukocyte chemotaxis等通路在止咳化痰配伍中特异回调。Negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway via death domain receptors等通路在活血通络配伍中特异回调。结论:补肺健脾方各配伍回调炎症反应相关通路的强度及数量均依次为活血通络、止咳化痰、温肾、补肺、健脾配伍。补肺健脾方可通过各配伍回调positive regulation of interleukin 1 production等共性通路及negative regulation of leukocyte chemotaxis等特异性通路干预炎症反应。