目的 分析永不有丝分裂基因A相关激酶2(NEK2)基因在恶性胸膜间皮瘤(MPM)中的表达及预后意义。方法 下载癌症基因组图谱(TCGA)数据库MPM基因表达数据、临床病理数据和生存状态数据;使用perl软件和R语言的limma、timeROC等程序包作NEK2基因在MPM中的差异分析、临床病理相关性分析、COX单因素和多因素分析以及基因富集分析,并绘制ROC曲线;利用TIMER2.0数据库分析MPM中NEK2表达与常见的免疫细胞浸润的相关性。选取12例MPM组织和6例非MPM胸膜组织,通过RT-qPCR的方法验证NEK2基因在MPM与非瘤组织中的表达情况。结果 与正常肺组织相比,NEK2在MPM组织中高表达(P<0.001)。NEK2基因mRNA表达量与MPM淋巴结分期具有显著相关性(P<0.05);NEK2高表达与MPM患者预后不良相关(P<0.001);NEK2基因表达与MPM中B淋巴细胞、巨噬细胞、树突状细胞浸润水平呈正相关(P<0.05),并在细胞周期、DNA复制、剪接体、mRNA监测等通路显著富集。在收集到的病例样本中,与非MPM胸膜组织相比,NEK2基因在MPM组织中的表达量显著增高(P<0.01)。结论 NEK2在MPM组织中高表达,且NEK2在MPM中高表达提示预后不良,可能成为治疗MPM的潜在靶点。
李锦松;李彬;刘如爱;普元倩;自加吉;余敏;熊伟;
大理大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室,云南大理671000 云南省昆虫生物医药研发重点实验室,云南大理671000 云南省高校临床生物化学检验重点实验室,云南大理671000大理大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室,云南大理671000 云南省昆虫生物医药研发重点实验室,云南大理671000云南大学生命科学学院生物化学与分子生物学实验室,云南昆明650091
临床医学
恶性胸膜间皮瘤;永不有丝分裂基因A相关激酶2;癌症基因组图谱;预后;生物信息学
《右江医学》 2024 (002)
P.103-111 / 9
国家自然科学基金(82160516);云南省应用基础研究专项面上项目(202201AT070004,202301AT070023);云南省地方本科高校基础研究联合专项面上项目(202101BA070001-226);云南省地方本科高校基础研究联合专项青年项目(202101BA070001-282);云南省昆虫生物医药研发重点实验室开放课题(AG2022003,AP2022006)。
10.3969/j.issn.1003-1383.2024.02.002
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