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m7G RNA甲基化关键调控因子在乳腺癌中的表达和预后价值OA

中文摘要

目的 通过生物信息学方法筛选有关乳腺癌的关键调控因子,研究其在乳腺癌治疗与预后的作用。方法 利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库,提取和下载m7G RNA甲基化调控因子和乳腺癌患者数据,使用基因富集分析(GSEA)数据库查找m7G RNA甲基化相关基因。通过共识聚类分析两种不同临床因素的乳腺癌组织聚类,使用最小绝对值收缩和筛选算子(LASSO)与比例风险回归模型Cox回归分析构建预后特征,并使用高通量基因表达数据库(GEO)进行结果验证。结果 共筛选出33个m7G RNA甲基化相关调控因子,有27个调控因子在乳腺癌组织样本中高表达,在共识聚类中,将样本中的乳腺癌患者分成聚类1和聚类2,发现聚类1的预后比聚类2差,且大部分m7G RNA甲基化调控因子在聚类1中存在更高的表达。同时,通过构建风险模型,筛选出了IF4E、 EIF4E3、 LARP1、 NCBP1 4个预后相关关键调控因子,并结合临床数据验证其可靠性。通过单因素和多因素Cox分析,证明其是乳腺癌患者的独立预后影响因素。结论 IF4E、 EIF4E3、 LARP1、 NCBP1这4个关键调控因子在乳腺癌的治疗和预后的判断上具有一定的价值。

罗凯迪;陈建荣;

右江民族医学院公共卫生与管理学院,广西百色533000

临床医学

乳腺癌;甲基化;预后价值;生物信息学;调控因子

《右江医学》 2024 (002)

P.112-120 / 9

广西教育科学“十四五”规划2022年度高校创新创业教育专项课题(2022ZJY2799);2022年度广西高等教育本科教学改革工程项目(2022JGA292);右江民族医学院2020年度校级科研课题(yy2020gcky037)。

10.3969/j.issn.1003-1383.2024.02.003

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