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COL1A2在头颈部鳞癌中的差异表达及功能分析OA

中文摘要

目的 采用生物信息学方法探讨COL1A2在头颈部鳞癌(HNSC)中的表达及相关功能。方法 利用TIMER2.0数据库分析COL1A2基因在泛癌中的表达;通过GEPIA数据库、UALCAN数据库分析该基因在HNSC与正常组织中的差异表达情况;并利用STRING数据库构建COL1A2基因蛋白互作网,DAVID数据库分析与该基因互作蛋白基因的相关功能;最后通过GCBI基因雷达数据库预测该基因可能参与的调控网络和转录因子。结果 COL1A2在多种肿瘤中高表达,且在头颈部鳞癌组织与正常组织中有差异表达。COL1A2及相关蛋白基因功能富集分析发现其参与了4个细胞组分、5个分子功能、11个生物学程序、7条信号通路,在基因调控网及转录因子预测发现,COL1A2与多种蛋白、转录因子、lncRNA、micRNA等相互调控。结论 COL1A2与HNSC的发生、发展可能是通过PI3K-Akt信号通路等多种途径、多种蛋白、转录因子共同调控的结果。

李钰颖;刘洁兰;侯沅林;卢诗丽;胡婷;吴彬;唐玉莲;

右江民族医学院医学检验学院,广西百色533000右江民族医学院临床医学院,广西百色533000

临床医学

COL1A2;生物信息学;头颈部鳞癌;基因表达

《右江医学》 2024 (002)

P.121-126 / 6

2022年大学生创新创业训练计划自治区级立项项目(S202210599011,S202210599096,S202210599050);2021年大学生创新创业训练计划自治区级立项项目(S202110599074);右江民族医学院2018年度校级科研课题(yy2018ky015)。

10.3969/j.issn.1003-1383.2024.02.004

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