为了丰富大叶黄精(Polygonatum kingianum var.grandifolium)根茎发育的转录组数据,发掘参与皂苷生物合成的功能基因,基于Illumina深度测序平台,对大叶黄精根茎进行转录组测序,并对次生代谢途径中皂苷的生物合成通路进行深入解析。结果显示,大叶黄精根茎的转录组数据经拼接后获得198296条转录本、92858条基因序列。基于超高效液相色谱和串联质谱(ultra performance liquid chromatography-tandem mass spectrometry,UPLC-MS/MS)检测平台和自建数据库共检测到238种差异显著代谢物。根据大叶黄精皂苷合成途径中酶基因注释和差异基因的表达及代谢途径富集的分析,一共找到3条合成皂苷途径的相关通路以及33个酶基因,推测这些酶基因在皂苷合成途径中起关键作用。该研究为大叶黄精的转录组学和代谢组学研究提供了丰富的参考数据,对于大叶黄精的功能基因组学研究具有重要意义。
崔泓实;梁思琪;石广地;崔令军;肖强;
生物资源保护与利用湖北省重点实验室,湖北恩施445000生物资源保护与利用湖北省重点实验室,湖北恩施445000 湖北民族大学林学园艺学院,湖北恩施445000
农业科学
大叶黄精;转录组学;代谢组学;Illumina深度测序平台;超高效液相色谱;皂苷生物合成途径
《湖北民族大学学报（自然科学版）》 2024 (001)
P.1-10 / 10
国家自然科学基金项目(31260057);湖北省科技厅技术创新重大专项项目(2019ACA120);湖北省自然科学基金项目(2023AFD077)。
10.13501/j.cnki.42-1908/n.2024.03.001
评论