目的鉴定灰毡毛忍冬Lonicera macranthoides MADS-box家族基因并进行生物信息学分析与表达模式验证,克隆湘蕾型和野生型灰毡毛忍冬MADS-box家族成员CMB1全长。方法基于转录组数据,利用在线工具对灰毡毛忍冬MADS-box进行生物信息学分析,并利用qRT-PCR验证MADS-box基因在不同品种中的表达模式,通过RT-PCR、RACE技术克隆湘蕾型和野生型灰毡毛忍冬CMB1基因全长。结果28个灰毡毛忍冬MADS-box蛋白长度为89~359 aa,碱性蛋白占比85.7%,不稳定蛋白占比96.4%,亲水性蛋白占比96.4%,均定位于细胞核,均为无跨膜结构的非分泌蛋白。转录组显示,与野生型比较,湘蕾型中28个MADS-box基因有17.86%表达下调,MIKCC型基因中有18.75%表达下调。克隆得到在两个品种的灰毡毛忍冬花中高度特异性表达的CMB1基因全长,均包含一个738 bp的ORF,编码245个氨基酸。CMB1基因在两个品种的花中表达量存在显著差异(P<0.01),且与茎、叶相比,在花中高度特异性表达(P<0.01)。结论基于灰毡毛忍冬转录组数据,鉴定了28个MADS-box家族基因,克隆得到湘蕾型与野生型灰毡毛忍冬CMB1基因全长,为进一步研究灰毡毛忍冬花发育、优良表型形成的分子机制提供研究基础与理论依据。
付学森;刘紫璇;王玲;龙雨青;曾娟;周日宝;刘湘丹;
湖南中医药大学药学院,湖南长沙410208湖南中医药大学药学院,湖南长沙410208 湘产大宗道地药材种质资源及规范化种植重点研究室,湖南长沙410208 湖南省普通高等学校中药现代化研究重点实验室,湖南长沙410208 湖南省中药饮片标准化及功能工程技术研究中心,湖南长沙410208
中医学
灰毡毛忍冬;MADS-box基因家族;表达分析;CMB1基因;基因克隆;表型变异
《湖南中医药大学学报》 2024 (003)
P.383-394 / 12
国家自然科学基金项目(82373992);湖南省自然科学基金项目(2021JJ30497,2021JJ30515);国家现代农业产业技术体系(CARS-21);湖南中医药大学研究生创新训练项目(2022CX79,2023CX152);2020年湖南省一流专业建设点:中药资源与开发;湖南中医药大学重点学科中药学科(校行发规字2023:2号)。
10.3969/j.issn.1674-070X.2024.03.006
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