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利用CRISPR/Cas9系统制备斑马鱼cbsb敲除模型OACSTPCD

中文摘要

目的 采用成簇的规律性间隔的短回文重复序列(CRISPR)/Cas9系统对斑马鱼胱硫醚-β-合成酶b基因(cbsb)进行编辑,并制备稳定的斑马鱼cbsb敲除品系。方法 使用ClustalX软件分析斑马鱼cbsb编码蛋白(Cbsb)的保守结构域,利用生物信息学选取向导RNA(gRNA)靶点,体外合成并纯化gRNA和密码子优化的Cas9 mRNA,在刚受精的斑马鱼胚胎(1-cell期)中显微注射混合的gRNA和Cas9 mRNA,提取受精后3 d的斑马鱼幼鱼基因组,通过PCR扩增并测序分析靶点的切割效率,通过基因组扩增和测序筛选并获得cbsb敲除的稳定品系。结果 斑马鱼Cbsb与人、小鼠胱硫醚-β-合成酶(CBS)高度同源。在斑马鱼Cbsb保守结构域的编码序列处设计4个靶点,其中4#靶点具有高效的切割效率,利用该靶点制备并筛选获得多个cbsb敲除斑马鱼,选取-3+13 bps和-228 bps移码突变的两种品系,进一步筛选获得稳定的cbsb敲除品系。结论 利用CRISPR/Cas9系统成功制备了两种斑马鱼cbsb敲除的稳定品系,为进一步在斑马鱼活体中研究Cbsb的功能奠定了基础。

陈福海;蒋林;曹建斌;蒋伟青;项略;顾珊烨;刘犇;

浙江大学医学院附属第一医院泌尿外科,杭州310003浙江省台州医院超声科浙江省台州医院麻醉科上海交通大学附属第六人民医院神经内科温州医科大学附属眼视光医院基础研究中心

生物学

胱硫醚-β-合成酶b;硫化氢;基因敲除;斑马鱼;成簇的规律性间隔的短回文重复序列/Cas9

《浙江医学》 2024 (004)

P.377-383 / 7

浙江省医药卫生科技计划项目(2022RC293)。

10.12056/j.issn.1006-2785.2024.46.4.2023-2213

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