目的 整合胃癌(GC)分子亚型和代谢相关基因,并依此构建GC预后模型。方法 从基因综合表达(GEO)数据库中采集GC患者基因表达谱和临床数据,通过整合网络分析筛选出主调控上皮间质转化(EMT)亚型的代谢标志基因,再通过Cox比例风险回归整合标志基因与生存信息,构建基于代谢相关基因的GC预后模型;依据该模型对GC患者进行风险分层,采用Kaplan-Meier生存曲线评估模型的预后预测作用,通过基因集富集分析(GSEA)筛选富集的通路。结果 整合网络分析筛选出3个主调控EMT亚型的代谢标志基因,分别为人脂质磷酸磷酸酶相关蛋白4型基因、谷氨酸胺-果糖-6-磷酸转氨酶2基因和硫酸酯酶1基因;基于这3个代谢标志基因构建的预后模型可将GC患者划分为高危组和低危组。生存曲线分析表明,高危组患者的预后更差,在多组验证数据集中均呈现一致结果,该模型表现出较强的预后预测效能。GSEA分析表明,高危组中转化生长因子-β信号传导、EMT等与癌恶性特征相关的通路显著富集;M2巨噬细胞、M0巨噬细胞及中性粒细胞浸润与高风险显著相关。结论 基于代谢相关基因的GC预后模型可实现GC患者风险分层,有助于指导GC患者的精准治疗。
杨永;张蕾;舒鹏;
宁波大学附属第一医院检验科,315000宁波市北仑区人民医院分子实验室
临床医学
胃癌;预后;代谢;标志物
《浙江医学》 2024 (004)
P.347-353,I0004 / 8
浙江省病理生理学技术研究重点实验室开放基金(201914)。
10.12056/j.issn.1006-2785.2024.46.4.2023-1475
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