肺腺癌患者预后预测模型的建立与验证OACSTPCD

目的通过探索影响肺腺癌预后、分期和免疫微环境的标志物来预测患者的生存预后。方法利用R语言Limma包筛选从UCSC基因组网站上获得的差异表达基因(DEGs);应用clusterProfiler包进行GO和KEGG通路富集分析。随机拆分样本方法将数据划分为训练集和验证集(比率=0.6∶0.4)。应用LASSO算法和随机森林算法来选择预测因子并构建列线图;研究CACNA2D2和CD79A的免疫浸润与预后的关系并采用ROC曲线和DCA曲线评价列线图的临床应用价值。通过Western印迹法和qRT-PCR实验分析肺腺癌细胞CACNA2D2、CD79A mRNA和蛋白表达水平。采用免疫组织化学染色检测48例肺腺癌患者肿瘤组织CACNA2D2和CD79A表达情况。结果共鉴定出42个上调差异基因和19个下调差异基因,只有CACNA2D2和CD79A与肿瘤分期和生存预后高度相关。其中,CD79A的过表达与免疫反应相关。CACNA2D2和CD79A低表达组的肺腺癌患者出现淋巴结转移和较差预后的风险显著增加。构建了基于关键基因的列线图模型,使用ROC曲线和DCA曲线对模型进行验证。实验结果发现肺腺癌细胞与正常支气管上皮细胞相比,CACNA2D2和CD79A表达较低,并且肺腺癌组织CACNA2D2和CD79A阴性更多出现在Ⅲ~Ⅳ期患者以及有远处转移的患者,而强阳性更多出现在Ⅰ~Ⅱ期患者以及未发生远处转移的患者。结论肿瘤中CACNA2D2和CD79A低表达与肺腺癌患者的肿瘤分期和较差的总生存期相关,CACNA2D2和CD79A可能是肺腺癌的潜在预后标志物和治疗靶点。