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水稻遗传育种相关生物信息数据库和工具的研究进展OACSCDCSTPCD

Research progress on bioinformatics databases and tools related to rice genetics and breeding

中文摘要

水稻Oryza sativa L.是主要的粮食作物,也是单子叶植物研究的模式植物.面对日益严峻的环境和人口压力,培育高产、优质、环境适性强的水稻品种是解决当前粮食安全问题的有效途径.随着多组学技术的快速发展,积累了海量的水稻遗传育种相关的数据.生物信息数据库和在线分析工具是存储这些数据的载体,用以整合、可视化和共享数据,并为数据的深入挖掘和利用提供工具,从而为育种决策提供数据支撑.本综述系统梳理了近 20 年来开发的水稻生物信息数据库和在线分析工具,并基于内置数据集和功能对它们进行了分类和总结.最后,讨论了现有的水稻生物信息数据库和在线分析工具的问题与不足,并对它们在大数据和人工智能时代的发展方向进行了展望.

彭歆;钱乾;谭健韬;彭波;甘玉立;王成睿;刘琦;沈梦圆

广东省农业科学院水稻研究所/广东省水稻育种新技术重点实验室/广东省水稻工程实验室/农业农村部华南优质稻遗传育种实验室(部省共建),广东广州 510640

农业科学

水稻;遗传育种;生物信息数据库;在线分析工具

Rice;Genetics and breeding;Bioinformatics database;Online analysis tool

《华南农业大学学报》 2023 (006)

854-866 / 13

广东省农业科学院协同创新中心项目(XTXM202203);广东省农业科学院水稻研究所"优谷计划"(2023YG08);省级乡村振兴战略专项"种业振兴项目"(2022NJS00004);广东省水稻育种新技术重点实验室项目(2020B1212060047)

10.7671/j.issn.1001-411X.202306065

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