不同繁殖阶段中华穿山甲肠道菌群研究

[目的]研究中华穿山甲妊娠前后生殖激素、肠道菌群组成结构、短链脂肪酸浓度的变化规律，揭示肠道菌群与生殖激素之间的关联性。[方法]采集10只中华穿山甲114份粪便样本(n=25配种前;n=56妊娠期;n=33分娩后)。采用放射免疫技术(RIA)检测粪便雌二醇、孕酮、卵泡刺激素、黄体生成素的浓度。通过16S rRNA技术分析中的微生物分类组成，用液相色谱-串联质谱联用(LC-MS/MS)法对粪便中的短链脂肪酸进行检测。Spearman相关性分析筛选与生殖激素和短链脂肪酸相关的差异菌群。[结果]粪便孕酮浓度在妊娠前期达到高峰后逐渐下降，卵泡刺激素和黄体生成素水平在从妊娠中期到分娩后逐渐下降。妊娠期粪便菌群α多样性显著低于配种前，毛螺菌科(Lachnospiraceae)相对丰度在妊娠后显著减少，相反乳杆菌科(Lactobacillaceae)相对丰度在妊娠后显著升高。值得关注的是，分娩后的穿山甲有更高丰度的变形菌门(Proteobacteria)，一些潜在的致病菌如埃希氏-志贺氏菌属(Escherichia-Shigella)的丰度增加。相较配种前和分娩后，妊娠穿山甲的粪便乙酸、丁酸浓度最低，而异丁酸、异戊酸和戊酸浓度随着妊娠和分娩的发展显著升高。Spearman相关性分析显示，韦荣氏球菌科(Veillonellaceae)和Lachnospiraceae_unclassified相对丰度与粪便乙酸、丁酸浓度呈显著正相关;Lachnospiraceae_unclassified、Clostridium_sensu_stricto_1与红球菌属(Rhodococcus)的相对丰度与粪便孕酮水平呈正相关，Lachnospiraceae_unclassified与卵泡刺激素和黄体生成素水平呈负相关。[结论]中华穿山甲的肠道微生物的组成结构在妊娠阶段发生了显著变化，其中一些细菌的变化与短链脂肪酸和生殖激素生成具有相关性，这些细菌可能是益于中华穿山甲繁育的候选益生菌。需要进一步的研究来阐述肠道微生物对中华穿山甲妊娠的影响，挖掘提高繁殖成功率、改善产后恢复和子代生长发育的潜在益生菌，促进中华穿山甲的人工繁育发展。