不同来源SSR引物对刺梨种群遗传差异性分析

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中文摘要

研究刺梨EST-SSR与近缘物种萨蔓莎月季的EST-SSR对刺梨种群遗传分析产生的差异,为刺梨遗传多样和遗传结构研究提供不同来源SSR标记位点。采用 6 对萨蔓莎月季EST-SSR引物和 6 对刺梨EST-SSR引物对261个野生刺梨样本进行基因分型,利用GenAlex软件估算群体遗传多样性参数、遗传分化系数和基因流,并进行AMOVA分子方差分析,采用SPSS Statistics 软件进行方差分析和相关性分析,NTSYS软件计算遗传相似度并按照UPGMA方法进行聚类。12 对SSR引物共扩增出 95 条带,其中萨蔓莎月季SSR引物扩增出 53 条带,刺梨SSR引物扩增出 42 条带。基于萨蔓莎月季SSR引物估算出的平均期望等位基因数目、期望杂合度、多态性信息含量和香浓信息指数分别为 2.206、0.477、0.459 和 0.862,比刺梨SSR引物估算出的相应指标分别低了 1.274、0.205、0.215和0.451.遗传分化结果显示,基于月季SSR和刺梨SSR估算的遗传分化系数FST分别为 0.128和0.062,均表明群体属于低等遗传分化水平。基于两种 SSR 标记的群体 AMOVA 分析结果基本相同,遗传变异主要来源于群体内。遗传距离相关性结果显示,两种来源的SSR得到的结果无显著相关性,而聚类结果相似。萨蔓莎月季SSR与刺梨SSR在进行遗传多样性和遗传距离分析时存在一定的差异,但差异并不显著;遗传分化和AMOVA分析得到的结果极为相似,表明近缘物种萨蔓莎月季的SSR在刺梨中通用性比较好,为后续刺梨种质资源收集、品种鉴定和指纹图谱构建提供了标记位点,为蔷薇科植物遗传多样性分析提供了新的思路。

刘粉粉;黄秦军;高铖铖;刘进;欧国腾;莫亮团;

中国林业科学研究院林业研究所 北京 100091;中国林业科学研究院林业研究所 北京 100091;中国林业科学研究院林业研究所 北京 100091;贵州省黔南州林业局 都匀 558099;贵州省黔南州林业局 都匀 558099;贵州省黔南州林业局 都匀 558099;

第九届中国林业学术大会

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